Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP2Q8IXW5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP2Q8IXW5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms