Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4DQ86TL0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms