Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMIM5Q71RC9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM5Q71RC9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms