Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC141Q6ZP82 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC141Q6ZP82 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms