Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L2Q6R6M4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms