Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 35.7
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PRPF8Q6P2Q9 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 35.7
PRPF8Q6P2Q9 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 35.7
PRPF8Q6P2Q9 MCM4-209ENST00000520637 839 ntTSL 29.36□□□□□ -0.914e-9■■■■■ 35.7
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PRPF8Q6P2Q9 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 35.7
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PRPF8Q6P2Q9 KIF2C-207ENST00000480574 783 ntTSL 59.32□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 35.6
PRPF8Q6P2Q9 MMS22L-209ENST00000509383 3083 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 35.6
PRPF8Q6P2Q9 DGKE-205ENST00000572944 5179 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.321e-10■■■■■ 35.6
PRPF8Q6P2Q9 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 35.6
PRPF8Q6P2Q9 UTP6-202ENST00000477128 2344 ntTSL 25.4□□□□□ -1.543e-7■■■■■ 35.6
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PRPF8Q6P2Q9 ATG3-208ENST00000495756 1455 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 35.6
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