Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMBQ6NW40 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGMBQ6NW40 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms