Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
REEP3Q6NUK4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP3Q6NUK4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms