Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD2Q6NTF9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms