Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHEQ5VZ18 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms