Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCH8Q5T0T0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms