Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VWC2Q2TAL6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms