Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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