Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA2Q15822 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA2Q15822 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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