Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNHIT3Q15649 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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