Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms