Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC23BQ15437 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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SEC23BQ15437 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SEC23BQ15437 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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