Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RYR3Q15413 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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