Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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GPNMBQ14956 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPNMBQ14956 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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GPNMBQ14956 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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