Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNC3Q14003 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC3Q14003 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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