Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DDX39BQ13838 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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