Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBB3Q13509 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TUBB3Q13509 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TUBB3Q13509 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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