Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3B2Q13367 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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