Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SGCGQ13326 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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