Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF6Q13247 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF6Q13247 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms