Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB40BQ12829 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RAB40BQ12829 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB40BQ12829 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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RAB40BQ12829 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB40BQ12829 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RAB40BQ12829 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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