Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4DQ08499 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4DQ08499 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms