Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM3Q08188 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms