Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE4BQ07343 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDE4BQ07343 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms