Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DEUP1Q05D60 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms