Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDM2Q00987 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM2Q00987 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms