Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTCQ00610 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTCQ00610 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms