Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP1P78357 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms