Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSNK2A1P68400 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms