Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIK1P57059 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK1P57059 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK1P57059 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK1P57059 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms