Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BACE1P56817 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BACE1P56817 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE1P56817 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE1P56817 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms