Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSWP56202 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSWP56202 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSWP56202 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSWP56202 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSWP56202 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms