Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FCGRTP55899 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FCGRTP55899 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms