Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARFIP1P53367 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFIP1P53367 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms