Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NESP48681 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NESP48681 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NESP48681 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NESP48681 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NESP48681 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NESP48681 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NESP48681 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NESP48681 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NESP48681 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NESP48681 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NESP48681 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms