Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC1P41238 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms