Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPB2P35606 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPB2P35606 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPB2P35606 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPB2P35606 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPB2P35606 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPB2P35606 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPB2P35606 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPB2P35606 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms