Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
BRS3P32247 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRS3P32247 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms