Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA5P30532 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms