Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM4SF1P30408 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM4SF1P30408 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms