Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCKSP29966 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms