Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP1P29466 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms