Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFYAP23511 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFYAP23511 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NFYAP23511 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NFYAP23511 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NFYAP23511 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFYAP23511 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFYAP23511 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFYAP23511 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms