Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCC1P18754 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCC1P18754 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RCC1P18754 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RCC1P18754 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCC1P18754 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RCC1P18754 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms