Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR1P18146 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR1P18146 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms